L'étude des rythmes biologiques

Pour ceux qui s'intéressent aux rythmes biologiques et surtout la découverte d'un rythme, je vous propose de tester quelques outils gratuits qui sont des compléments aux outils standards comme le Cosinor. Depuis l'existence de la chronobiologie et de ses applications cliniques, les chercheurs découvrent des pistes dans le domaine génétique avec le dernier composant chrono, mais on retrouve aussi beaucoup de choses pour l'origine des cancers ou l'évolution de la chronothérapie.  Ces troubles des rythmes biologiques seraient également responsables de maladies car une meilleure compréhension du vieillissement et des activités de travail révèlent une discontinuité fondamentale. Dans le domaine sportif, de nombreuses études ont permis de mettre en évidence l'importance de l'alimentation, les altérations de rythme du sommeil et la fréquence cardiaque. Pour aborder dans de bonnes conditions l’approche des rythmes biologiques, il est important de comprendre comment on découvre une période ou rythme à partir de mesures.

L’étude statistique d’analyse d’un phénomène périodique est complexe et la divergence des modèles utilisés dans plusieurs études ne permet pas de comparer les résultats. Il existe trois étapes essentielles pour mener à bien la recherche, la qualité de distributions des données, l’utilisation des analyses spectrales pour rechercher des périodes dans les données et tests de validation de la modélisation de la période.

Pour comprendre l'intérêt du programme Circwave, il suffit de regarder l'exemple ci-dessous que j'ai réalisé avec une prise journalière de la température corporelle sur 4 jours. L'ensemble des données se trouve sur deux colonnes avec les heures (H) et les mesures (T°). Il faut enregistrer votre  fichier sous format .csv pour être reconnu par le programme.

Circwave analyse les données indépendantes et transforme celles-ci en courbe de Fourier pour voir l'expression d'un rythme.

Les paramètres sont visibles pour la valeur F, la valeur du p, etc. Le calcul du profil s'inspire d'une régression harmonique linéaire à partir d'une fonction:

Je vous conseille de regarder les ressources sur Euroestech: systèmes scientifiques pour l'analyse des phénomènes rythmiques, l'analyse des séries chronologiques et de prévision. Vous trouverez des exemples de différentes séries expérimentales ou fictives. Sur une autre page, les publications, collaborations et activités du laboratoire. Vous trouverez également la page de téléchargement du logiciel du Time Series Analysis Cosinor 6.3.

Un grand merci à Benoît Mauvieux* pour la découverte des rythmes en chronobiologie. Vous pouvez lire un article intéressant sur le sujet : Etudes comparées des rythmes circadiens et reflet actimétrique du sommeil de sportifs et de sédentaires en poste régulier de nuit, par Benoît Mauvieux, Bruno Sesboüe, et Damien Davenne.
Une autre ressource pour les ostéopathes, "Chronobiologie et ostéopathie", mémoire en 1996 réalisé par Mr Laurent Moreau, Maître de mémoire G. de Coux.

*Thèse de Benoit Mauvieux, Dr de l'Université de Caen, le 3 Décembre 2004. Titre: Effets d'un entrainement physique et sportif régulier, chronique ou temporaire, sur les rythmes biologiques du travailleur de nuit.

Crétation d'applications pédagogiques avec Cleverlize

Cleverlize Beta est actuellement en version gratuite pour créer des applications en html 5 (anglais) pour utilisateurs de IOS, Android, Windows phone. Vous pouvez choisir plusieurs formats de présentation à destination des étudiants, soit des quizz ou flashcards, des vidéos ou des textes simples pour présenter des articles avec droits d'auteur. Il n'est pas nécessaire d'avoir des connaissances en programmation pour créer votre première application. Actuellement, les étudiants utilisent de plus en plus leur smartphone ou la tablette pour suivre des informations. Il est parfois nécessaire de joindre l'utile à l'agréable en proposant des supports de révision ou d'autoévaluation aux étudiants sur des outils familiers pour eux.

Mode d'emploi

La création de votre compte gratuit sur Cleverlize consiste à donner vos coordonnées avec un mot de passe et de valider le mail de retour pour activer le compte.

Puis, il faut choisir votre contenu en sélectionnant un modèle prédéfini, vous construisez ensuite votre scénario en fonction de l'objectif.

Vous pouvez voir la construction de votre contenu et revenir sur des sections pour modifier ou valider votre choix. Vous pourrez à tout moment revenir sur la configuration d'origine lors de l'aperçu de votre application.

Une fois que votre contenu est configuré, vous déterminez les paramètres pour le rendu final. Inutile de jouer sur les couleurs et les fonds. N'oubliez pas l'objectif de votre publication.

Vous testez votre application en utilisant votre navigateur ou votre smartphone après avoir scanner le code QR ou cliquer sur l'url générée.

Il vous reste à diffuser l'information sur un site ou un blog pour communiquer sur l'outil. Par principe, si on construit une application avec un outil gratuit, l'application devrait être gratuite !

A droite le QR code pour les articles BloggerOsteo92.

A gauche, vous pouvez voir la maquette d'une application sur 100 questions en sémiologie que je prépare sous la forme de flashcards. On verra si les étudiants apprécient ce genre de support.

Présentation d'une classe virtuelle Engrade

Engrade est une solution en ligne pour proposer des cours et des échanges entre un enseignant et des étudiants, soit en formateur individuel, soit dans le cadre d'une institution. Le tableau de bord d'un compte enseignant permet de voir rapidement les classes associées et actives, ainsi que les cours assignés à chaque classe.

Après la création d'une classe, vous pouvez mettre en place un message à destination des étudiants. Chaque classe possède des options et des paramètres spécifiques à l'intérieur d'un menu.

Parmi les applications proposées, il existe des modules pour créer un Quiz. Ce premier outil sera utile pour vérifier l'acquisition des plusieurs notions vues lors d'un cours ou d'un trimestre. Il faut faire attention pour les questions car le programme anglo-saxon n'autorise pas toutes les polices dans votre texte. Donc, faire attention aux accents et ponctuations.

Dans le même genre, il existe aussi un module pour créer des Flashcards, très pratique pour soumettre des questions et vérifier si l'étudiant comprend les sujets. Le module propose soit une réponse unique, soit un choix multiple avec correction en fin de cession.

On retrouve enfin un module d'écriture comme un Wiki qui permet de soumettre un cas clinique, ou de proposer des liens vers des articles scientifiques, ou des vidéos sur YouTube. Pour caque cas, il existe une possibilité de réponse des étudiants par le biais d'une messagerie interne entre l'apprenant et le professeur, mais également avec autorisation de l'enseignant, une discussion sur le thème entre les étudiants.

Enfin, vous pouvez télécharger des fichiers à partager avec les étudiants. C'est la seule limite du programme avec 250 Mo de stockage sur le serveur.

L'autre intérêt sur Engrade, c'est le partage des formations et des modules entre enseignants. Dans la section Flashcards, on retrouve toute la liste des questionnaires proposés par tous les enseignants inscrits sur Engrade par catégories.

Cette fonction de partage existe également pour tous les wikis proposés par les enseignants inscrits sur Engrade. On imagine l'importance du système collaboratif entre les différents enseignants.

Chaque classe présente dans votre compte comporte plusieurs paramètres, dont la création des étudiants soit en individuel, soit par import d'une liste en fichier .csv.
Tous les étudiants sont identifiés, ce qui permet lors d'évaluations d'offrir à celui-ci les résultats des Quiz, des Flascards, etc.

Lors de la création d'une classe, vous devez mettre en forme les critères pour la période en cours, le niveau de la classe, la période scolaire, etc. Dans ce menu, il faut jouer avec les propositions car le système scolaire américain est différent par rapport à l'Europe. Mais cela ne pose aucun problème pour sélectionner des choix appropriés.

Vous trouverez toutes les réponses à vos questions sur le support très complet qui est proposé en ligne (en anglais).

Présentation de Socrative

De plus en plus de dispositifs pédagogiques intègrent des dispositifs de sondages en temps réel qui permettent à des apprenants de répondre via différents outils connectés à Internet (ordinateur, tablette, smartphone…). Ces derniers sont d’excellents outils pour prendre le pouls de la classe ou pour poser une question anonyme sur un sujet délicat avant d’entreprendre une discussion.

L’outil en ligne Socrative permet de créer des sondages, Quizz et QCM (questionnaires à choix multiple) et d’obtenir des réponses immédiates jusqu’à 50 utilisateurs (en mode gratuit). Socrative est une application web gratuite, en anglais, aussi disponible sur iOS et Android. dont le principe est simple mais nécessite l'accès à un réseau internet. L’enseignant se crée un compte et obtient un numéro de classe. Ses élèves utilisent ce numéro de classe pour se connecter à leur enseignant. Une fois connectés, les élèves doivent attendre que l’enseignant pose une question.

Lorsque l’enseignant le désire, il peut poser une question de type « choix de réponse » ou « réponse courte ». Ce qui est intéressant est que la question n’est pas écrite dans Socrative. La question est plutôt posée à l’oral par l’enseignant, écrite dans sa présentation PowerPoint ou encore écrite sur le tableau. Socrative sert uniquement à collecter les réponses. Par exemple, l’enseignant pourrait demander si des notions sont comprises en proposant 3 possibilités et écrire des choix de réponses au tableau : «A, B, C». Sur les téléphones ou les ordinateurs des élèves, on verrait alors les lettre A, B  et C et ils devraient en choisir une. En temps réel, l’enseignant pourrait voir combien d’élèves ont répondu à chaque choix de réponse et ajuster la suite du cours en fonction des résultats.

Socrative permet aussi à l’enseignant de préparer des questionnaires. Dans ce cas, il est possible de taper, en texte seulement, la question, les choix de réponses et indiquer laquelle est la bonne. Ces questionnaires peuvent être également partagés entre les enseignants à l’aide d’un simple code. Lorsqu’on prépare un questionnaire et qu’on le fait faire à nos élèves, la différence majeure est que nous obtenons un rapport Excel où l’on peut voir le nom de chaque élève, leur réponse à chaque question et une note globale. C’est idéal pour effectuer un suivi plus personnalisé et un feed-back .

Le formateur a une vision permanente du nombre d’inscrits connectées et des réponses ce qui lui permet de commenter en direct les résultats et d’animer sa présentation en intégrant le niveau de compréhension de la salle.

Le site propose un accès "étudiant" et un accès "enseignant". Les étudiants rentrent ensuite le code d'accès ou "pièce" à rejoindre donné par le professeur et cela sans inscription préalable, ce qui facilite grandement la tâche. Pour rejoindre l’espace des étudiants. Pour rejoindre l’espace des professeurs.

Un tableau de bord permet à l'enseignant d'avoir accès aux différentes possibilités d'interaction avec les étudiants ou les conférenciers. Pour chaque item, il proposera un accès à une classe virtuelle ou Room pour permettre aux auditeurs de répondre.

Soit les réponses à un questionnaire ou un Quiz arrivent sur un tableau en ligne sur le compte de l'enseignant qui pourra conserver une trace en exportant un fichier Excel. Ce support est intéressant pour connaître l'évolution nominative de chaque étudiant après un cours ou une série de cours et cerner les difficultés rencontrées.

Soit les réponses en direct arrivent directement sur l'écran de l'ordinateur ou du portable de l'enseignant, retransmis sur écran pour les étudiants. Cette fois, les réponses sont anonymes mais permettent de voir très rapidement si les notions nouvelles ou acquises sont intégrées.

Ce système peut être utilisé soit en début de cours, soit en fin de cours, mais si possible pendant une période d'accès au réseau wifi de l'établissement. Ainsi, l'usage du portable est justifié uniquement à des fins pédagogiques.

Il existe d'autres produits que je n'ai pas testé mais qui semblent très prometteurs.

Quiz Socket est une application basée sur le web qui ne nécessite aucune installation sur un appareil. Elle fonctionne sur tous les smartphones testés, gratuit et simple.

Mentimeter est un outil ultime pour l'interaction avec un public, lors d'une conférence ou tout simplement pour l'échange avec les étudiants. C'est un outil facile pour créer des questions, recueillir les réponses et montrer le résultat en temps réel. Voir également kahoot et gosoapbox.

A noter qu’un mode d’emploi en français est mis à disposition par Essyllt Louarn et Marie-Joëlle Ramage, enseignantes-chercheuses à l’Université Paris Sud (en pdf) : Socrative : Le QCM rapide! Une application Web 2.0 pour évaluer la compréhension de vos étudiants.

Vidéo de démonstration proposée par Mickie Mueller

Présentation de Jogtheweb

Lorsque vous arrivez sur le site de JogTheweb, vous découvrez plusieurs catégories proposées par des internautes. Il s'agit d'une forme de curation évoluée qui encourage l'agrégation d'informations sous forme de scénario. Il est possible de faire un montage de vos recherches sur la Toile pour construire un parcours pédagogique ou traiter un thème.

Pour proposer un parcours à vos lecteurs, vous devez vous inscrire gratuitement pour un compte qui vous permettra de suivre les commentaires des internautes ainsi que le nombre de vues de votre recherche. Quand vous êtes en ligne sur votre compte, vous devez voir dans l'onglet Vos Jogs la liste de vos présentations avec le nombre de vues.

Lors d'une création de présentation, on vous demande le titre et le thème à choisir dans une liste. Il s'agit de bien renseigner les champs pour être certain que votre recherche se trouve au bon endroit.

Il est possible par la suite d'inclure votre présentation dans un site, un blog ou par d'autres réseaux.

Noter qu'il existe un index présente en haut de page qui permet l'impression de la page pour retrouver les liens de chaque Jog.

Le nombre d'étapes ou de liens est affiché en bleu pour chaque présentation. Le nombre n'est pas limité pour l'instant. Dans ma dernière présentation sur des animations en anatomie, j'ai mis 27 étapes !

Présentation du logiciel Images Actives

Le site images-actives.crdp-versailles.fr est un site du CRDP de l’académie de Versailles. C’est le site de présentation du logiciel « Images Actives ».

Images actives est publié sous licence GNU-GPL, La version 1.0 est lancée le 30 novembre 2011 et est disponible sur le site officiel. Une documentation relative à l'application Images Actives du CRDP de l'Académie de Versailles.

Téléchargement sans restriction pour un usage personnel.

Initialement, cet outil permettait dans le cadre des SVT ou toutes les disciplines scolaires d'avoir recours à des schémas statiques comportant des légendes associées à des textes porteurs d'une information. L'idée d'amener le concepteur d'un projet à utiliser une animation active suggère une démarche plus stimulante pour l'étudiant, qui peut utiliser le schéma interactif comme outil de révision. Certains professeurs ont pris l’initiative de mettre l’application Images Actives directement entre les mains des élèves. Une expérience a été menée avec succès à l’occasion de la semaine de la presse à l’internat d’excellence de Marly-le-Roi : les productions des élèves sont consultables.

Deux modes principaux d’utilisation sont possibles:

- dans le premier, l’utilisateur a préalablement réalisé le détourage de ses détails à l’aide d’un logiciel de traitement d’image. Il importe alors dans Images Actives les fichiers obtenus

- dans le second mode d’utilisation, l’utilisateur importe son image et réalise son détourage dans Images Actives avec les outils proposés.

Quand l'image est importée, il est possible de saisir les mentions légales sur le titre de l'image, le propriétaire, les droits d'auteur du projet et surtout le source de l'image.

Dans la fenêtre de droite apparaît votre image qui servira de support pour votre découpage.

Dans le deuxième volet, vous sélectionnez les détails que vous désirez voir apparaître sur votre animation. Chaque détail sera souligné par un déroutage, elliptique, rectangulaire ou avec lasso. Prenez soin de faire cette partie avec beaucoup de précision pour obtenir un excellent résultat. Vérifier à la fin la synchronisation entre les détails nommés et les commentaires qui apparaissent lors d'une sélection de souris.

Chaque commentaire accompagne un déroutage. Le texte est mis en forme dans le champ en bas à gauche. Il est possible d'insérer un lien hypertexte qui sera opérationnel uniquement lors de la mise en ligne de votre animation sur Internet.

Vous pouvez ensuite choisir le modèle de présentation qui correspond au type d'image utilisée, ainsi que le champ approprié pour le texte. Vous verrez dans cette section du programme le choix d'un modèle pour un quiz.

Dans la section suivante, vous paramétrez les options de couleurs pour les différents segments de votre présentation. Ce choix doit être précis en fonction de votre fond sur le site ou blog où vous désirez mettre en ligne votre travail.

La dernière étape consiste à choisir le format complet ou partiel de sortie de votre fichier Flash. L’animation obtenue, au format swf, a vocation à être déployée sur le web et consultée dans un navigateur. Elle peut-être utilisée sur tout ordinateur (Windows, Mac OS ou Linux) et sur une grande partie des appareils mobiles. L’utilisateur du logiciel Images Actives peut également enregistrer son travail dans un fichier portant l’extension ’.xia’ (pour Projet Images Actives). Il pourra ainsi l’éditer à nouveau ultérieurement pour y apporter des modifications.

Au-delà des possibilités initiales, ce programme offre de réelles perspectives pour des présentations originales. Dans le cadre de cours dans une formation en Ostéopathie, vous pouvez utiliser cet outil comme Enseignant ou Etudiant :

1. Mettre en forme des liens entre des structures d'une région
2. Préciser des zones anatomiques stratégiques grâce au zoom puissant du programme
3. Faire un exposé thématique avec informations et liens vers des articles
4. Décrire des rapports précis entre des structures anatomiques
5. Exposer des zones avec liens vers vidéos sur Internet
6. Faire un mémo des rapports pour chaque suture
7. Faire un exposé sur les différentes douleurs projetées d'un organe
8. etc....

Présentation du logiciel I-Spring Free

Je vous propose aujourd'hui de découvrir le logiciel I-Spring Free 6.2 qui est un Plugin pour le programme d'Office Microsoft PowerPoint. Ce logiciel permet une conversion de votre fichier PPT en fichier Flash, ce qui représente deux avantages:

1. Vos animations prennent vie avec plus de fluidité et interactivité
2. Le poids du fichier final est beaucoup moins volumineux qu'un PPT classique

Une fois votre programme télécharger et installer sur votre ordinateur, il apparaît un nouvel onglet dans la barre des tâches de votre PowerPoint.

Lors de l'inscription sur le site de l'éditeur, vous bénéficiez d'un compte qui permet de voir vos applications téléchargées et validées avec une clé de licence.

A partir de l'onglet principal, vous pouvez insérer un Quiz avec un sous programme Free quiz maker, un fichier Flash ou une vidéo sur Youtube. Maintenant, regardons de plus près la fonction Publier.

Vous trouvez plusieurs options pour le format de sortie de votre présentation en Flash. Ce niveau est important en fonction de vos choix pour une démonstration classique magistrale mettant en valeur les animations, ou si vous décidez d'une prise en main manuelle de l'utilisateur dans le cas d'un fichier interactif.

Le niveau de difficultés est minime, même pour des débutants.

Pour bien utiliser I-Spring Free, il faut déjà connaître les fonctionnalités de base de PowerPoint, en particulier tout ce qui concerne l'animation avec les paramètres du Timeline et la distribution des séquences. Un autre point important, c'est l'utilisation des déclencheurs sous PowerPoint permettant l'activation par un utilisateur d'une action avec la souris ! Dans le cadre de QCM ou de diaporama interactif, ce dernier point est fondamental.

Pour la mise en place d'un Quiz, l'éditeur I-Spring propose une version gratuite et limitée de Free Quiz Maker qui permet l'insertion dans un PowerPoint de QCM avec questions et réponses évoluées, mais il offre aussi la possibilité de faire un QCM à partir d'images. Il faut préparer les images en amont, soit au niveau des légendes, soit sur le dessin lui-même, puis on soumet des questions avec visualisation de l'image. Il est tout à fait possible de programmer un minutage entre chaque diapositive pour donner juste le temps à un étudiant d répondre à de contrôle continu en ligne !

Pour suivre la formation à ce programme, inscrivez-vous sur le site Osteo92.

Une présentation conceptuelle des compétences

Ci-dessous, vous pouvez voir le résultat de mon premier travail sur le programme Focusky Presentation Maker. J'ai repris une carte conceptuelle des compétences d'après des auteurs réalisée lors de mon Master 2 Pro avec Cmap tools pour montrer l'intérêt d'un tel outil. Noter la simplicité et l'impact des informations pour chaque item. Il est possible d'intégrer des vidéos, des fichiers flash et plus encore.

Nouvelle acquisition

Depuis hier, j'ai obtenu un sésame pour télécharger Focusky Zooming Presentation Maker 2014 d'une valeur de 99$ qui est un logiciel commercial offert gratuitement pendant 24 heures en  licence gratuite. Focusky Zooming Presentation Maker 2014 est un logiciel qui permet de créer des présentations de qualité professionnelle, avec un nouveau concept innovant et attrayant concernant l'affichage en ligne ou hors ligne. Focusky vous fournit une plate-forme ouverte pour combiner du texte, des liens hypertexte, les formes et les multimédias dans une présentation. Multimédias telles vidéo en ligne YouTube, Vimeo vidéo, Flash local (*. Swf) et flv vidéo sont pris en charge. La version actuelle (V 1.2.1) de Focusky Présentation Maker est construite pour la plate-forme Windows XP/Vista/7/8. Toutefois, les présentations numériques créées avec Focusky sont multi-plateformes, y compris Windows, Macintosh OSX et Linux. Le logiciel de présentation peut produire soit *. Exe ou * format html., Le .Exe est uniquement pour Windows, et le HTML peut travailler sur différentes plateformes et navigateurs.

Une société connue pour le développement de logiciels de présentation de décision, Focusky Software Co. a lancé Focusky Présentation Maker , un outil de présentation en ligne qui permet aux utilisateurs, en particulier les éducateurs à créer des effets visuels interactifs et attrayants pour l'enseignement.

Visant à révolutionner les processus de construction des connaissances pour les jeunes, Focusky Software Co. a développé un logiciel de présentation créative qui dispose d'animation, zoom, panoramique et fonctions plein écran. Et au lieu de diapositives, il utilise une toile comme support, totalement en rupture avec les conventions de présentations PowerPoint traditionnels.

Avec cela, les séances d'apprentissage deviennent plus intéressantes. Il fournit également aux enseignants une plus grande flexibilité dans la communication avec les élèves et une efficacité dans la présentation de l'objet.

Focusky dispose ce qui suit:

Présentation dynamique

Il reproduit les mouvements de l'appareil telles que le zoom, la rotation et le recadrage. Il présente des idées de loin, puis zoom et se concentrant sur elle pendant un certain temps. Il présente également de gauche à droite, ou dans le sens horaire ou anti-horaire, des présentations mémorables.

Solliciter la place de diapositives

Il encourage l'imagination sans restriction de l'emplacement des idées. Ainsi, les utilisateurs sont libres de mettre les idées n'importe où dans la toile.

Implanté en Chine depuis 2008, Focusky Software Co. est une société de logiciels et de technologie qui développe des logiciels de présentation en ligne avec innovation. C'est surtout une alternative aux produits plus connus comme Prezi, voir le tableau comparatif.

Pour l'utilisation de Prezi en ligne, c'est gratuit pendant 1 mois en hébergement avec 500 Mo de stockage. Maintenant, nous allons voir si le programme téléchargé est à la hauteur et permet une réelle autonomie par rapport à ses concurrents. On teste et je vous tiens au courant.

Liste des programmes testés depuis 3 mois

Je vous propose un aperçu des différents programmes testés par l'intermédiaire de ce remarquable carroussel de Ligams. Télécharger le fichier sur cette page et je vous proposerais un tutoriel sur Osteo 92.

La construction des savoirs

Dans le précédent article, j'expliquais l'intérêt pour les Enseignants et les Etudiants de mobiliser des ressources pour construire une vision personnalisée des savoirs acquis. Pour les étudiants, ces outils peuvent également servir de vecteur pour mieux appréhender des notions difficiles, mais ils permettent aussi de formaliser tous les liens entre les matières étudiées pour réaliser une transversalité des connaissances indispensable à de nouvelles compétences.

Ci-dessous, je vous propose un exemple concret d'utilisation des concepts en apprentissage à travers un exposé au format Flash réalisé avec PowerPoint 2007 et le logiciel I-Spring Free. Bien entendu, les tutoriels sur ce logiciel gratuit seront inclus dans la formation proposé sur le site Osteo 92 pour différentes réalisations.

Je vous expliquerais également l'intérêt de vous inscrire sur le site SlideBoom (en partenariat avec I-Spring Free pour 100 présentations gratuites) pour exposer vos travaux.

Concept global en Ostéopathie, approche didactique

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